Desde el 2013, We Effect ha explorado las posibilidades de colaborar con organizaciones en Colombia.
En el 2017 We Effect realiza un proyecto piloto de programa país en Colombia, combinando su trabajo en desarrollo rural y vivienda y hábitat, siempre con énfasis en la igualdad de derechos entre mujeres y hombres. En el 2018 la junta directiva de We Effect decide ampliar su trabajo en la región de América Latina mediante la cooperación con organizaciones en Colombia.
Con el apoyo de la oficina de la Agencia Sueca para el Desarrollo Internacional, Asdi, en Colombia, We Effect ha iniciado un proyecto de reincorporación en conforme a los acuerdos de paz entre el gobierno de Colombia y el movimiento guerrillero FARC, que se firmaron en 2016.
